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基因编辑一站式交付案例

时间:2018-04-12   

在水稻单基因编辑一站式服务中,您仅需提供基因编号。

我们将完成剩下的工作,最终按需求交付水稻苗或者种子。

同时您还可以选择更加便捷的数据和文章服务,方便您进行文章发表和课题申请。 

 

客户提供基因编号

基因编号:LOC_Os06g04200

 

我们提供免费实验设计方案及以下数据

一、靶位点信息:

1、靶位点序列:

GGCATGAACGTCGTGTTCGT

2、靶位点位置:

weidian.png


3、靶位点特异性分析:

top 10 genome-wide off-target sites

Sequence

Score

MMs

Locus

Gene

Region

GGCGTCACCGTCGTGTTCGTCAG

1.5

3MMs

Chr5:-4032151


Intergenic

GGCAGGAACATCATGTTCGTCAG

1.0

3MMs

Chr1:+1057727

LOC_Os01g02900

cds

GCCGTCACCGTCGTGTTCGTCAG

0.8

4MMs

Chr5:-4093649

LOC_Os05g07626

cds

GCGATGAACTTCGTGTTCGCCGG

0.6

4MMs

Chr11:-3926632

LOC_Os11g07690

cds

GCCAGGAACGGCGTGTTCGGCGG

0.4

4MMs

Chr2:+28979711

LOC_Os02g47450

cds

GGCAGGCACGTCGCGTTCGTCGG

0.3

3MMs

Chr6:-7032278

LOC_Os06g12850

cds

AGCATGAACGGCGCGTTCGTCAG

0.3

3MMs

Chr9:-15283593

LOC_Os09g25490

cds

GGCAGGAACACCATGTTCGTCAG

0.3

4MMs

Chr12:-7669030

LOC_Os12g13640

cds

GTCCTCAACGTCGTCTTCGTCGG

0.2

4MMs

Chr12:+25331547

LOC_Os12g40920

intron

GGCAACTACGTCGTGTCCGTCGG

0.2

4MMs

Chr9:+18522838

LOC_Os09g30414

cds



二、T0代转基因苗信息:

提供不少于25棵T0代转基因阳性苗

突变率数据:

s1.PNG


纯合突变类型数据:

s2.png


纯合株系大田表型描述:

海南种植纯合株系比野生型略矮

三、T1代种子:

提供多余5个独立株系含突变的种子,包括多余3个独立株系的纯合种子(如果有*),多于2个独立株系的杂合种子;2个无突变独立株系种子(如果有#)及无转化野生型对照一份。

 

*:有的基因致死或无纯合株系,只能提供杂合株系种子;

#:有的时候突变效率达100%,只能从后代筛选无突变的野生型对照。


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